Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdr2P97817 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdr2P97817 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdr2P97817 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdr2P97817 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdr2P97817 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdr2P97817 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms