Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitx2P97474 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pitx2P97474 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pitx2P97474 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms