Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp2P97299 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfrp2P97299 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp2P97299 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms