Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgfbiP82198 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TgfbiP82198 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TgfbiP82198 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TgfbiP82198 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms