Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nucb2P81117 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nucb2P81117 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nucb2P81117 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nucb2P81117 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nucb2P81117 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nucb2P81117 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nucb2P81117 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nucb2P81117 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nucb2P81117 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nucb2P81117 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nucb2P81117 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nucb2P81117 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nucb2P81117 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms