Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptprn2P80560 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptprn2P80560 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptprn2P80560 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptprn2P80560 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptprn2P80560 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptprn2P80560 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ptprn2P80560 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptprn2P80560 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptprn2P80560 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptprn2P80560 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptprn2P80560 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms