Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8a1P70704 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8a1P70704 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8a1P70704 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp8a1P70704 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms