Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UrodP70697 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UrodP70697 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UrodP70697 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UrodP70697 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UrodP70697 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UrodP70697 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UrodP70697 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UrodP70697 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UrodP70697 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UrodP70697 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UrodP70697 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UrodP70697 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UrodP70697 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UrodP70697 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UrodP70697 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UrodP70697 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UrodP70697 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UrodP70697 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UrodP70697 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UrodP70697 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UrodP70697 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UrodP70697 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UrodP70697 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UrodP70697 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UrodP70697 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UrodP70697 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UrodP70697 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UrodP70697 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UrodP70697 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UrodP70697 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UrodP70697 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UrodP70697 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UrodP70697 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UrodP70697 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UrodP70697 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UrodP70697 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UrodP70697 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UrodP70697 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UrodP70697 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UrodP70697 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UrodP70697 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UrodP70697 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UrodP70697 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UrodP70697 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UrodP70697 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UrodP70697 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UrodP70697 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UrodP70697 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UrodP70697 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UrodP70697 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UrodP70697 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UrodP70697 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrodP70697 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrodP70697 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrodP70697 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrodP70697 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrodP70697 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UrodP70697 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UrodP70697 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UrodP70697 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrodP70697 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UrodP70697 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UrodP70697 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UrodP70697 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UrodP70697 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UrodP70697 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UrodP70697 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrodP70697 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UrodP70697 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrodP70697 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrodP70697 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrodP70697 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrodP70697 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrodP70697 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UrodP70697 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UrodP70697 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UrodP70697 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UrodP70697 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UrodP70697 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UrodP70697 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UrodP70697 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UrodP70697 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UrodP70697 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UrodP70697 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UrodP70697 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UrodP70697 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UrodP70697 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UrodP70697 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UrodP70697 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrodP70697 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrodP70697 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UrodP70697 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UrodP70697 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UrodP70697 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UrodP70697 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UrodP70697 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UrodP70697 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UrodP70697 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UrodP70697 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 336.9 ms