Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ldb1P70662 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ldb1P70662 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ldb1P70662 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ldb1P70662 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ldb1P70662 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldb1P70662 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms