Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeboxP70368 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SeboxP70368 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SeboxP70368 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SeboxP70368 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SeboxP70368 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SeboxP70368 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms