Protein–RNA interactions for Protein: P70353

Nfyc, Nuclear transcription factor Y subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfycP70353 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfycP70353 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfycP70353 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfycP70353 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfycP70353 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfycP70353 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfycP70353 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfycP70353 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfycP70353 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfycP70353 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfycP70353 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfycP70353 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfycP70353 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfycP70353 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfycP70353 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfycP70353 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfycP70353 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfycP70353 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfycP70353 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfycP70353 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfycP70353 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfycP70353 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfycP70353 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfycP70353 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfycP70353 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfycP70353 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfycP70353 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfycP70353 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfycP70353 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfycP70353 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfycP70353 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfycP70353 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfycP70353 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NfycP70353 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NfycP70353 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfycP70353 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfycP70353 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfycP70353 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfycP70353 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfycP70353 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfycP70353 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfycP70353 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfycP70353 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfycP70353 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfycP70353 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NfycP70353 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfycP70353 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfycP70353 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfycP70353 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfycP70353 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfycP70353 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfycP70353 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfycP70353 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfycP70353 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfycP70353 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfycP70353 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfycP70353 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfycP70353 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfycP70353 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfycP70353 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfycP70353 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfycP70353 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfycP70353 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfycP70353 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfycP70353 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfycP70353 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfycP70353 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfycP70353 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NfycP70353 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfycP70353 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfycP70353 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfycP70353 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfycP70353 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfycP70353 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfycP70353 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfycP70353 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfycP70353 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfycP70353 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfycP70353 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfycP70353 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NfycP70353 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfycP70353 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfycP70353 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfycP70353 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfycP70353 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfycP70353 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfycP70353 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfycP70353 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfycP70353 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfycP70353 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfycP70353 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfycP70353 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfycP70353 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfycP70353 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfycP70353 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfycP70353 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfycP70353 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfycP70353 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfycP70353 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfycP70353 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 786 ms