Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnb1P62874 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gnb1P62874 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gnb1P62874 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1P62874 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gnb1P62874 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gnb1P62874 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gnb1P62874 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gnb1P62874 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gnb1P62874 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gnb1P62874 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gnb1P62874 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gnb1P62874 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gnb1P62874 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gnb1P62874 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms