Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdo1P60334 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdo1P60334 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdo1P60334 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdo1P60334 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdo1P60334 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdo1P60334 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms