Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms