Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtdsplP58465 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtdsplP58465 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtdsplP58465 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtdsplP58465 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtdsplP58465 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms