Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctbp2P56546 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctbp2P56546 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctbp2P56546 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctbp2P56546 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctbp2P56546 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctbp2P56546 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms