Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd38P56528 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd38P56528 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd38P56528 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd38P56528 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd38P56528 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd38P56528 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd38P56528 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd38P56528 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd38P56528 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd38P56528 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd38P56528 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd38P56528 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd38P56528 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd38P56528 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd38P56528 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd38P56528 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd38P56528 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd38P56528 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd38P56528 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd38P56528 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd38P56528 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd38P56528 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd38P56528 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd38P56528 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd38P56528 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd38P56528 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd38P56528 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd38P56528 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd38P56528 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd38P56528 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd38P56528 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd38P56528 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd38P56528 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms