Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolgP54099 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolgP54099 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolgP54099 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolgP54099 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolgP54099 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolgP54099 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PolgP54099 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PolgP54099 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PolgP54099 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolgP54099 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolgP54099 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolgP54099 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolgP54099 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolgP54099 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolgP54099 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolgP54099 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolgP54099 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolgP54099 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolgP54099 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolgP54099 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolgP54099 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolgP54099 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolgP54099 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolgP54099 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolgP54099 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolgP54099 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolgP54099 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolgP54099 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolgP54099 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolgP54099 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolgP54099 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolgP54099 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolgP54099 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolgP54099 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolgP54099 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolgP54099 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolgP54099 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolgP54099 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PolgP54099 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolgP54099 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolgP54099 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolgP54099 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolgP54099 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolgP54099 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PolgP54099 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PolgP54099 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PolgP54099 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PolgP54099 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PolgP54099 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PolgP54099 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PolgP54099 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PolgP54099 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PolgP54099 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PolgP54099 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PolgP54099 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PolgP54099 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PolgP54099 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PolgP54099 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PolgP54099 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PolgP54099 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PolgP54099 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PolgP54099 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PolgP54099 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolgP54099 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolgP54099 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolgP54099 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolgP54099 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolgP54099 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolgP54099 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolgP54099 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolgP54099 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolgP54099 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolgP54099 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PolgP54099 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PolgP54099 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PolgP54099 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PolgP54099 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PolgP54099 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PolgP54099 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PolgP54099 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PolgP54099 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PolgP54099 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PolgP54099 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PolgP54099 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PolgP54099 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PolgP54099 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PolgP54099 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PolgP54099 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PolgP54099 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PolgP54099 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PolgP54099 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PolgP54099 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PolgP54099 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PolgP54099 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PolgP54099 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PolgP54099 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PolgP54099 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolgP54099 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolgP54099 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms