Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RabggtbP53612 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RabggtbP53612 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RabggtbP53612 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RabggtbP53612 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RabggtbP53612 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RabggtbP53612 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RabggtbP53612 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RabggtbP53612 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RabggtbP53612 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RabggtbP53612 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RabggtbP53612 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RabggtbP53612 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RabggtbP53612 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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