Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BckdhaP50136 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BckdhaP50136 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BckdhaP50136 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BckdhaP50136 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BckdhaP50136 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BckdhaP50136 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BckdhaP50136 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BckdhaP50136 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms