Protein–RNA interactions for Protein: P49660

Sstr4, Somatostatin receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr4P49660 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sstr4P49660 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sstr4P49660 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sstr4P49660 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sstr4P49660 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sstr4P49660 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sstr4P49660 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms