Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg3P47867 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg3P47867 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg3P47867 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg3P47867 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg3P47867 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg3P47867 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg3P47867 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg3P47867 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg3P47867 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scg3P47867 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg3P47867 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scg3P47867 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg3P47867 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg3P47867 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg3P47867 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg3P47867 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg3P47867 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scg3P47867 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scg3P47867 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg3P47867 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg3P47867 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg3P47867 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg3P47867 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg3P47867 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg3P47867 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg3P47867 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg3P47867 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg3P47867 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scg3P47867 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg3P47867 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg3P47867 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg3P47867 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms