Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf4P43488 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf4P43488 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf4P43488 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf4P43488 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf4P43488 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf4P43488 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf4P43488 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf4P43488 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf4P43488 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf4P43488 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf4P43488 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms