Protein–RNA interactions for Protein: P41158

Elk4, ETS domain-containing protein Elk-4, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk4P41158 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk4P41158 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk4P41158 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk4P41158 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elk4P41158 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk4P41158 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elk4P41158 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk4P41158 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk4P41158 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elk4P41158 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elk4P41158 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elk4P41158 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elk4P41158 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elk4P41158 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elk4P41158 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elk4P41158 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elk4P41158 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elk4P41158 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elk4P41158 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elk4P41158 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms