Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ighmbp2P40694 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ighmbp2P40694 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ighmbp2P40694 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ighmbp2P40694 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms