Protein–RNA interactions for Protein: P36100

TFA1, Transcription initiation factor IIE subunit alpha, yeastyeast

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFA1P36100 SUT2YPR009W 807 nt12.89□□□□□ -0.35
TFA1P36100 PMT2YAL023C 2280 nt12.88□□□□□ -0.35
TFA1P36100 PSD1YNL169C 1503 nt12.88□□□□□ -0.35
TFA1P36100 GET3YDL100C 1065 nt12.88□□□□□ -0.35
TFA1P36100 YIP3YNL044W 531 nt12.88□□□□□ -0.35
TFA1P36100 DUT1YBR252W 444 nt12.88□□□□□ -0.35
TFA1P36100 SRG1SRG1 551 nt12.87□□□□□ -0.35
TFA1P36100 RRT7YLL030C 342 nt12.87□□□□□ -0.35
TFA1P36100 MER1YNL210W 813 nt12.87□□□□□ -0.35
TFA1P36100 VPS75YNL246W 795 nt12.87□□□□□ -0.35
TFA1P36100 BTS1YPL069C 1008 nt12.87□□□□□ -0.35
TFA1P36100 IES1YFL013C 2079 nt12.87□□□□□ -0.35
TFA1P36100 CTL1YMR180C 963 nt12.86□□□□□ -0.35
TFA1P36100 IRC11YOR013W 471 nt12.86□□□□□ -0.35
TFA1P36100 GUS1YGL245W 2127 nt12.86□□□□□ -0.35
TFA1P36100 DLD3YEL071W 1491 nt12.85□□□□□ -0.35
TFA1P36100 RRT5YFR032C 870 nt12.85□□□□□ -0.35
TFA1P36100 TIM17YJL143W 477 nt12.85□□□□□ -0.35
TFA1P36100 MTG1YMR097C 1104 nt12.85□□□□□ -0.35
TFA1P36100 GOR1YNL274C 1053 nt12.85□□□□□ -0.35
TFA1P36100 DAP1YPL170W 459 nt12.85□□□□□ -0.35
TFA1P36100 SHM2YLR058C 1410 nt12.85□□□□□ -0.35
TFA1P36100 MSS116YDR194C 1995 nt12.85□□□□□ -0.35
TFA1P36100 NFI1YOR156C 2181 nt12.84□□□□□ -0.35
TFA1P36100 SAY1YGR263C 1275 nt12.84□□□□□ -0.35
TFA1P36100 YIL086CYIL086C 309 nt12.84□□□□□ -0.35
TFA1P36100 YOR325WYOR325W 474 nt12.84□□□□□ -0.35
TFA1P36100 ATG32YIL146C 1590 nt12.84□□□□□ -0.35
TFA1P36100 AVT6YER119C 1347 nt12.84□□□□□ -0.35
TFA1P36100 GFA1YKL104C 2154 nt12.83□□□□□ -0.36
TFA1P36100 GCV1YDR019C 1203 nt12.83□□□□□ -0.36
TFA1P36100 AAD6YFL056C 639 nt12.83□□□□□ -0.36
TFA1P36100 NTG2YOL043C 1143 nt12.83□□□□□ -0.36
TFA1P36100 YGL101WYGL101W 648 nt12.82□□□□□ -0.36
TFA1P36100 HRT1YOL133W 366 nt12.82□□□□□ -0.36
TFA1P36100 HAL1YPR005C 885 nt12.82□□□□□ -0.36
TFA1P36100 SLM4YBR077C 489 nt12.82□□□□□ -0.36
TFA1P36100 MIF2YKL089W 1650 nt12.82□□□□□ -0.36
TFA1P36100 MRP13YGR084C 1020 nt12.81□□□□□ -0.36
TFA1P36100 ERG29YMR134W 714 nt12.81□□□□□ -0.36
TFA1P36100 YBR089WYBR089W 600 nt12.81□□□□□ -0.36
TFA1P36100 DHH1YDL160C 1521 nt12.81□□□□□ -0.36
TFA1P36100 CTI6YPL181W 1521 nt12.81□□□□□ -0.36
TFA1P36100 CMK1YFR014C 1341 nt12.81□□□□□ -0.36
TFA1P36100 GDH3YAL062W 1374 nt12.81□□□□□ -0.36
TFA1P36100 FRA1YLL029W 2250 nt12.8□□□□□ -0.36
TFA1P36100 YLL017WYLL017W 312 nt12.8□□□□□ -0.36
TFA1P36100 SPG5YMR191W 1122 nt12.8□□□□□ -0.36
TFA1P36100 ATG19YOL082W 1248 nt12.8□□□□□ -0.36
TFA1P36100 MDH2YOL126C 1134 nt12.8□□□□□ -0.36
TFA1P36100 YFL066CYFL066C 1179 nt12.79□□□□□ -0.36
TFA1P36100 DAT1YML113W 747 nt12.79□□□□□ -0.36
TFA1P36100 POX1YGL205W 2247 nt12.78□□□□□ -0.36
TFA1P36100 RBG2YGR173W 1107 nt12.78□□□□□ -0.36
TFA1P36100 NIT1YIL164C 600 nt12.78□□□□□ -0.36
TFA1P36100 PGC1YPL206C 966 nt12.78□□□□□ -0.36
TFA1P36100 Q0017Q0017 162 nt12.78□□□□□ -0.36
TFA1P36100 TAH18YPR048W 1872 nt12.78□□□□□ -0.36
TFA1P36100 YDR222WYDR222W 1248 nt12.77□□□□□ -0.37
TFA1P36100 ECM9YKR004C 1134 nt12.77□□□□□ -0.37
TFA1P36100 RCE1YMR274C 948 nt12.77□□□□□ -0.37
TFA1P36100 GLC8YMR311C 690 nt12.77□□□□□ -0.37
TFA1P36100 PRE6YOL038W 765 nt12.77□□□□□ -0.37
TFA1P36100 RCK1YGL158W 1539 nt12.77□□□□□ -0.37
TFA1P36100 SEC28YIL076W 891 nt12.76□□□□□ -0.37
TFA1P36100 OSH7YHR001W 1314 nt12.76□□□□□ -0.37
TFA1P36100 TFC6YDR362C 2019 nt12.76□□□□□ -0.37
TFA1P36100 YEF1YEL041W 1488 nt12.75□□□□□ -0.37
TFA1P36100 SUV3YPL029W 2214 nt12.75□□□□□ -0.37
TFA1P36100 BPL1YDL141W 2073 nt12.74□□□□□ -0.37
TFA1P36100 SGA1YIL099W 1650 nt12.74□□□□□ -0.37
TFA1P36100 MET2YNL277W 1461 nt12.74□□□□□ -0.37
TFA1P36100 RTN2YDL204W 1182 nt12.74□□□□□ -0.37
TFA1P36100 IRC14YOR135C 342 nt12.74□□□□□ -0.37
TFA1P36100 CIT2YCR005C 1383 nt12.73□□□□□ -0.37
TFA1P36100 DUO1YGL061C 744 nt12.73□□□□□ -0.37
TFA1P36100 TOM6YOR045W 186 nt12.73□□□□□ -0.37
TFA1P36100 CSG2YBR036C 1233 nt12.73□□□□□ -0.37
TFA1P36100 YJL045WYJL045W 1905 nt12.72□□□□□ -0.37
TFA1P36100 PRP46YPL151C 1356 nt12.72□□□□□ -0.37
TFA1P36100 SSU72YNL222W 621 nt12.72□□□□□ -0.37
TFA1P36100 ATG18YFR021W 1503 nt12.71□□□□□ -0.38
TFA1P36100 OPT1YJL212C 2400 nt12.71□□□□□ -0.38
TFA1P36100 NUR1YDL089W 1455 nt12.71□□□□□ -0.38
TFA1P36100 YEL028WYEL028W 462 nt12.7□□□□□ -0.38
TFA1P36100 VPS68YOL129W 555 nt12.7□□□□□ -0.38
TFA1P36100 ODC2YOR222W 924 nt12.7□□□□□ -0.38
TFA1P36100 SSL2YIL143C 2532 nt12.69□□□□□ -0.38
TFA1P36100 NDI1YML120C 1542 nt12.69□□□□□ -0.38
TFA1P36100 HCR1YLR192C 798 nt12.69□□□□□ -0.38
TFA1P36100 IML3YBR107C 738 nt12.69□□□□□ -0.38
TFA1P36100 PTR2YKR093W 1806 nt12.68□□□□□ -0.38
TFA1P36100 MRPL32YCR003W 552 nt12.68□□□□□ -0.38
TFA1P36100 ARI1YGL157W 1044 nt12.68□□□□□ -0.38
TFA1P36100 DCG1YIR030C 735 nt12.68□□□□□ -0.38
TFA1P36100 ERP2YAL007C 648 nt12.68□□□□□ -0.38
TFA1P36100 STP3YLR375W 1032 nt12.68□□□□□ -0.38
TFA1P36100 YLR402WYLR402W 192 nt12.68□□□□□ -0.38
TFA1P36100 HAT1YPL001W 1125 nt12.68□□□□□ -0.38
TFA1P36100 PTC4YBR125C 1182 nt12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.9 ms