Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfc1P35601 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rfc1P35601 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfc1P35601 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms