Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcr2P35343 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cxcr2P35343 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcr2P35343 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxcr2P35343 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcr2P35343 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms