Protein–RNA interactions for Protein: P31650

Slc6a11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a11P31650 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a11P31650 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a11P31650 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a11P31650 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a11P31650 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a11P31650 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a11P31650 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a11P31650 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a11P31650 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a11P31650 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a11P31650 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a11P31650 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a11P31650 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a11P31650 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms