Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vav1P27870 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vav1P27870 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vav1P27870 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav1P27870 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav1P27870 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav1P27870 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav1P27870 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vav1P27870 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vav1P27870 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vav1P27870 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vav1P27870 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vav1P27870 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vav1P27870 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vav1P27870 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vav1P27870 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vav1P27870 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vav1P27870 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vav1P27870 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vav1P27870 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vav1P27870 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vav1P27870 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vav1P27870 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vav1P27870 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vav1P27870 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms