Protein–RNA interactions for Protein: P25446

Fas, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FasP25446 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FasP25446 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FasP25446 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FasP25446 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FasP25446 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FasP25446 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FasP25446 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FasP25446 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FasP25446 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FasP25446 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FasP25446 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FasP25446 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FasP25446 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FasP25446 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FasP25446 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FasP25446 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FasP25446 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FasP25446 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FasP25446 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FasP25446 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FasP25446 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FasP25446 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FasP25446 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FasP25446 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FasP25446 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FasP25446 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FasP25446 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FasP25446 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FasP25446 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FasP25446 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FasP25446 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FasP25446 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FasP25446 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FasP25446 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FasP25446 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FasP25446 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FasP25446 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FasP25446 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FasP25446 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FasP25446 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FasP25446 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FasP25446 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FasP25446 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FasP25446 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FasP25446 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FasP25446 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FasP25446 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FasP25446 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FasP25446 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FasP25446 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FasP25446 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FasP25446 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FasP25446 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FasP25446 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FasP25446 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FasP25446 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FasP25446 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FasP25446 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FasP25446 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FasP25446 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FasP25446 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FasP25446 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FasP25446 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FasP25446 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FasP25446 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FasP25446 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FasP25446 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FasP25446 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FasP25446 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FasP25446 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FasP25446 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FasP25446 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FasP25446 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FasP25446 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FasP25446 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FasP25446 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FasP25446 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FasP25446 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FasP25446 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FasP25446 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FasP25446 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FasP25446 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FasP25446 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FasP25446 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FasP25446 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FasP25446 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FasP25446 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FasP25446 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FasP25446 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FasP25446 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FasP25446 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FasP25446 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FasP25446 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FasP25446 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FasP25446 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FasP25446 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FasP25446 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FasP25446 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FasP25446 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FasP25446 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms