Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnd1P25322 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnd1P25322 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccnd1P25322 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms