Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk1P22518 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk1P22518 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk1P22518 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk1P22518 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk1P22518 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk1P22518 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk1P22518 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk1P22518 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk1P22518 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk1P22518 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk1P22518 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk1P22518 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk1P22518 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk1P22518 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clk1P22518 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms