Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P20040 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P20040 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P20040 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P20040 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P20040 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P20040 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
P20040 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P20040 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
P20040 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P20040 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P20040 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
P20040 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P20040 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
P20040 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P20040 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
P20040 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P20040 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P20040 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
P20040 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
P20040 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
P20040 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
P20040 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P20040 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P20040 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P20040 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P20040 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P20040 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P20040 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P20040 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P20040 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P20040 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P20040 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P20040 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
P20040 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P20040 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P20040 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P20040 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
P20040 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P20040 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
P20040 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P20040 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P20040 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P20040 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P20040 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P20040 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P20040 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P20040 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
P20040 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P20040 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P20040 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P20040 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P20040 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
P20040 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P20040 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P20040 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P20040 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P20040 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P20040 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P20040 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P20040 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P20040 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P20040 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P20040 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P20040 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P20040 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P20040 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P20040 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P20040 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P20040 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P20040 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P20040 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P20040 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P20040 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P20040 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P20040 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms