Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ifrd1P19182 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifrd1P19182 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifrd1P19182 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifrd1P19182 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifrd1P19182 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifrd1P19182 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifrd1P19182 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifrd1P19182 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifrd1P19182 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifrd1P19182 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifrd1P19182 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms