Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18527 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18527 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18527 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18527 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18527 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18527 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18527 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18527 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18527 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18527 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18527 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18527 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18527 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18527 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18527 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18527 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18527 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18527 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18527 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18527 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18527 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P18527 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18527 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18527 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18527 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18527 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18527 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18527 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18527 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P18527 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18527 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18527 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18527 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P18527 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18527 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18527 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18527 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18527 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18527 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18527 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18527 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18527 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18527 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18527 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18527 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18527 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18527 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18527 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18527 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18527 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18527 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18527 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18527 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18527 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18527 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18527 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18527 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18527 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P18527 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18527 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18527 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18527 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18527 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18527 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18527 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18527 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18527 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18527 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18527 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18527 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18527 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P18527 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18527 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18527 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18527 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18527 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18527 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18527 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18527 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18527 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18527 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18527 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18527 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18527 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18527 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18527 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18527 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18527 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18527 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P18527 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18527 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18527 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18527 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18527 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18527 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18527 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18527 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18527 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18527 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms