Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UbbP0CG49 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UbbP0CG49 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UbbP0CG49 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.6 ms