Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06320 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06320 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P06320 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P06320 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06320 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06320 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06320 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06320 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06320 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06320 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06320 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06320 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06320 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06320 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06320 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06320 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06320 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06320 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06320 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06320 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06320 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06320 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06320 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06320 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06320 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06320 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06320 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06320 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06320 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06320 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06320 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06320 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06320 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06320 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06320 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06320 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06320 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06320 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06320 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06320 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06320 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06320 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P06320 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06320 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06320 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06320 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P06320 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06320 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06320 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06320 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06320 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06320 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06320 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06320 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06320 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06320 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06320 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06320 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06320 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06320 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06320 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06320 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06320 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06320 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06320 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06320 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06320 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06320 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06320 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06320 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06320 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06320 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P06320 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06320 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06320 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P06320 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06320 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06320 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06320 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06320 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06320 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06320 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06320 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06320 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06320 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06320 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06320 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06320 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P06320 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06320 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06320 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P06320 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06320 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06320 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06320 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06320 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06320 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06320 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06320 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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