Protein–RNA interactions for Protein: P05214

Tuba3a, Tubulin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba3aP05214 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tuba3aP05214 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tuba3aP05214 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba3aP05214 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba3aP05214 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tuba3aP05214 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tuba3aP05214 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tuba3aP05214 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tuba3aP05214 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms