Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
P01729 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
P01729 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16,75■□□□□ 0,27
P01729 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
P01729 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
P01729 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,74■□□□□ 0,27
P01729 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
P01729 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
P01729 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
P01729 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16,72■□□□□ 0,27
P01729 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
P01729 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
P01729 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16,71■□□□□ 0,27
P01729 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16,71■□□□□ 0,27
P01729 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
P01729 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,71■□□□□ 0,27
P01729 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16,71■□□□□ 0,27
P01729 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
P01729 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
P01729 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
P01729 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16,7■□□□□ 0,26
P01729 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16,7■□□□□ 0,26
P01729 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
P01729 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
P01729 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,69■□□□□ 0,26
P01729 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
P01729 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
P01729 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
P01729 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
P01729 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
P01729 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16,68■□□□□ 0,26
P01729 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,68■□□□□ 0,26
P01729 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
P01729 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
P01729 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16,68■□□□□ 0,26
P01729 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
P01729 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
P01729 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
P01729 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
P01729 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16,67■□□□□ 0,26
P01729 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16,67■□□□□ 0,26
P01729 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
P01729 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
P01729 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
P01729 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,66■□□□□ 0,26
P01729 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16,66■□□□□ 0,26
P01729 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,66■□□□□ 0,26
P01729 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
P01729 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
P01729 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
P01729 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
P01729 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16,65■□□□□ 0,26
P01729 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
P01729 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16,65■□□□□ 0,26
P01729 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
P01729 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
P01729 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,64■□□□□ 0,25
P01729 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
P01729 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
P01729 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16,64■□□□□ 0,25
P01729 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16,64■□□□□ 0,25
P01729 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
P01729 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,63■□□□□ 0,25
P01729 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
P01729 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
P01729 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
P01729 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16,62■□□□□ 0,25
P01729 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
P01729 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
P01729 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16,61■□□□□ 0,25
P01729 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
P01729 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16,61■□□□□ 0,25
P01729 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
P01729 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
P01729 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
P01729 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16,6■□□□□ 0,25
P01729 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
P01729 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
P01729 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
P01729 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16,59■□□□□ 0,25
P01729 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16,59■□□□□ 0,25
P01729 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
P01729 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
P01729 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16,58■□□□□ 0,24
P01729 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,58■□□□□ 0,24
P01729 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
P01729 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16,57■□□□□ 0,24
P01729 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
P01729 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
P01729 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
P01729 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
P01729 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16,56■□□□□ 0,24
P01729 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
P01729 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16,56■□□□□ 0,24
P01729 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
P01729 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
P01729 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
P01729 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16,55■□□□□ 0,24
P01729 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
P01729 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,55■□□□□ 0,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,1 ms