Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01673 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01673 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01673 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01673 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01673 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01673 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01673 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01673 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01673 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01673 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01673 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01673 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01673 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
P01673 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01673 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01673 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01673 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01673 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01673 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01673 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
P01673 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01673 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01673 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01673 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01673 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
P01673 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01673 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01673 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01673 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01673 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01673 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01673 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01673 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01673 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01673 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01673 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01673 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
P01673 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
P01673 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01673 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P01673 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01673 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01673 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
P01673 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01673 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01673 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01673 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01673 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01673 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01673 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01673 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01673 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01673 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01673 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01673 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01673 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01673 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01673 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01673 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01673 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01673 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01673 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01673 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01673 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01673 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01673 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01673 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01673 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01673 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01673 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01673 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01673 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01673 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01673 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01673 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01673 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01673 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01673 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P01673 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P01673 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01673 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01673 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01673 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01673 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01673 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01673 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01673 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01673 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01673 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01673 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01673 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01673 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01673 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01673 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01673 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01673 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01673 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01673 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
P01673 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms