Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl20O89093 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccl20O89093 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl20O89093 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl20O89093 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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