Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20,5■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20,48■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ccl20O89093 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20,42■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ccl20O89093 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20,39■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20,34■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Ccl20O89093 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20,32■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20,32■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20,32■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20,3■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20,27■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Ccl20O89093 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,83
Ccl20O89093 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Ccl20O89093 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Ccl20O89093 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Ccl20O89093 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20,25■□□□□ 0,83
Ccl20O89093 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Ccl20O89093 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Ccl20O89093 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Ccl20O89093 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms