Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hcn2O88703 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hcn2O88703 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hcn2O88703 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hcn2O88703 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hcn2O88703 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn2O88703 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hcn2O88703 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcn2O88703 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn2O88703 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms