Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnk4O88454 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnk4O88454 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnk4O88454 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnk4O88454 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnk4O88454 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms