Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clec11aO88200 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clec11aO88200 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clec11aO88200 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clec11aO88200 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clec11aO88200 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms