Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
Lnx1O70263 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lnx1O70263 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Lnx1O70263 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lnx1O70263 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lnx1O70263 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Lnx1O70263 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lnx1O70263 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lnx1O70263 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lnx1O70263 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lnx1O70263 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lnx1O70263 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lnx1O70263 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lnx1O70263 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
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