Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxq1O70220 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxq1O70220 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxq1O70220 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxq1O70220 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxq1O70220 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms