Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Alx3O70137 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21,28■■□□□ 1
Alx3O70137 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21,28■■□□□ 1
Alx3O70137 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Alx3O70137 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Alx3O70137 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Alx3O70137 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Alx3O70137 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Alx3O70137 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21,2■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Alx3O70137 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Alx3O70137 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Alx3O70137 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Alx3O70137 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Alx3O70137 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,12■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Alx3O70137 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Alx3O70137 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Alx3O70137 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Alx3O70137 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Alx3O70137 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,95
Alx3O70137 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Alx3O70137 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21,01■□□□□ 0,95
Alx3O70137 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Alx3O70137 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Alx3O70137 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Alx3O70137 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Alx3O70137 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Alx3O70137 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Alx3O70137 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Alx3O70137 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Alx3O70137 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Alx3O70137 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Alx3O70137 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,8 ms