Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxO54751 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxO54751 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxO54751 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxO54751 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxO54751 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxO54751 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxO54751 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxO54751 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CrxO54751 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxO54751 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxO54751 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxO54751 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxO54751 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CrxO54751 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxO54751 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxO54751 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxO54751 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxO54751 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CrxO54751 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CrxO54751 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxO54751 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxO54751 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxO54751 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxO54751 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxO54751 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxO54751 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CrxO54751 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxO54751 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxO54751 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxO54751 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxO54751 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxO54751 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxO54751 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxO54751 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxO54751 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxO54751 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxO54751 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxO54751 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxO54751 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxO54751 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxO54751 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxO54751 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxO54751 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxO54751 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxO54751 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxO54751 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxO54751 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxO54751 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxO54751 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrxO54751 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrxO54751 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrxO54751 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrxO54751 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrxO54751 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrxO54751 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrxO54751 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrxO54751 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrxO54751 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CrxO54751 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CrxO54751 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CrxO54751 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CrxO54751 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CrxO54751 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CrxO54751 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CrxO54751 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CrxO54751 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrxO54751 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrxO54751 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrxO54751 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CrxO54751 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CrxO54751 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CrxO54751 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CrxO54751 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CrxO54751 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CrxO54751 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CrxO54751 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CrxO54751 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxO54751 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxO54751 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxO54751 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxO54751 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxO54751 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxO54751 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxO54751 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxO54751 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxO54751 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxO54751 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxO54751 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxO54751 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxO54751 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxO54751 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxO54751 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxO54751 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxO54751 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxO54751 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CrxO54751 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxO54751 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxO54751 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxO54751 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms