Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lhx8O35652 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lhx8O35652 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lhx8O35652 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx8O35652 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx8O35652 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx8O35652 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms