Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfrsf11aO35305 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnfrsf11aO35305 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnfrsf11aO35305 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnfrsf11aO35305 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnfrsf11aO35305 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnfrsf11aO35305 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms